战役失败的原因，其中很大原因是，省军的混乱。
盛世才被调离新疆后，省军便处于群龙无首的状态，驻扎在各地的省军，从将领到士兵都人心惶惶，不知前途在那，士气降低；而从外地调到新疆的军队，则两眼抹黑，不清楚地形，不清楚本地情况，增援军队在翻越天山时，甚至迷路了，后勤军队甚至将弹药粮食送到了叛军的营地。
白崇禧没有命令省军将领到迪化开会，而是下令对在南疆平叛中立下功勋的省军新编骑兵第2师，骑兵第口2师将领宛凌云、张希汉进行嘉奖，授予俩人青天白日勋章，宣布将两个师扩编为乙种师，同时命令他们上报两师在南疆立功的手下，以便平叛指挥部上报嘉奖。
通令嘉奖玛纳斯河前线的省军暂编第师师长汤执权，奖赏暂编第师全师十万元。通令嘉奖固守阿克苏的6师，授予平定南疆的二十四军军长刘文辉，7师师长唐亮青天白日勋章，奖赏二十四军全军子十万法币。
白崇禧改刚到迪化时的低姿态，雷厉风行的推行了几大办法，叛军立刻感到压力倍增，莫斯科迅速与重庆联系，要求潘友新立刻与国民政府交涉，表达苏俄政府对新疆事态的关注，要求中国在措置新疆事变中采纳谨慎措拖王宠惠放下潘友新交过来的备忘录，眼中滑过丝聃讽，然后平静的将备忘录推到潘友新面前：“我国政府不克不及接受这份备忘录，新疆叛乱是我国内政，如何平定是我国政府的事，与贵国政府无关。”
“新疆与我国有漫长的边疆线，我国与新疆有持久的历史关系，所以我国很是关心新疆局势，对新疆目前初现的情况很是关心，我们希望贵国政府在解决新疆事变中采纳谨慎态度，这关系到我国与贵国的友好关系。”潘友新语含威胁的盯着王宠惠。
王宠惠冷笑两声，站起来走到潘友新身边，拿起桌上那份备忘录：“我担负国民政府外交部长前后两次，总共有十多年时间了，象这样的话已经听过很多了，从9年到叨97年，日本人曾经过很屡次，哟940年西藏产生事端时，英国人也曾经这样过，今天我又听到了。”
“贵我两国友好关系？真是笑话，贵我两国有友好关系吗？新疆叛乱难道不是贵国在背后指使？列昂诺夫这个名字知道吗？贵国内政部少校，他的特遣队在四天以前在哈密地区被我军歼灭，列昂诺夫已经被俘。”
“新疆叛军中有几多是贵国内务部军人？有几多是门g古军人？心里比我清楚。”王宠惠心中很是酣畅，作为外交人员，他很清楚苏俄这个举动中包含的含义。
潘友新也冷笑两声，他同样站起来”面对王宠惠：“部长先生，
从抗战之初到现在，我们对贵国进行了大量物资和人员支持，
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